美國(guó)的《Science》雜志由愛迪生投資創(chuàng)辦，是上的自然科學(xué)綜合類學(xué)術(shù)期刊，與英國(guó)的《Nature》雜志被譽(yù)為世界上兩大自然科學(xué)*雜志。Science雜志主要發(fā)表原始性科學(xué)成果、新聞和評(píng)論，許多世界上重要的科學(xué)報(bào)道都是首先出現(xiàn)在Science雜志上的，比如艾滋病與人類免疫缺陷病毒之間的關(guān)系，標(biāo)志性基因組研究成果等。Science雜志近期下載量zui多的文章包括：
1、It Takes More Than an Apple a Day
Caroline Ash, Paula Kiberstis, Eliot Marshall, John Travis
Sep 21, 2012; 337:1466-1467
近期Science雜志以“Disease Prevention”為題制作了關(guān)于疾病預(yù)防的專題，其中包含了癌癥疾病預(yù)防，藥物如何作用，修改飲食習(xí)慣，非傳染性疾病的預(yù)防措施等多個(gè)方面，主題文章“It Takes More Than an Apple a Day”指出，感染性疾病作為預(yù)防研究模型設(shè)置了一個(gè)高標(biāo)準(zhǔn)。由于疫苗和抗微生物藥物的發(fā)展和廣泛分布，我們現(xiàn)在能生活在一個(gè)沒有天花，脊髓灰質(zhì)炎（幾乎），瘧疾和艾滋病患病率都在下降的世界里。
這一專題就強(qiáng)調(diào)了目前非傳染性疾病預(yù)防領(lǐng)域中科學(xué)家們面臨的各種挑戰(zhàn)，一些基礎(chǔ)性的問題包括是否癌癥篩選的益處比患癌風(fēng)險(xiǎn)大，哪種形式的預(yù)防zui符合成本效益。還有在探討潛在的化學(xué)預(yù)防藥物，比如阿司匹林，維生素D，針對(duì)慢性疾病的疫苗，降低β-淀粉樣蛋白含量藥物中一個(gè)共同的主題——臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)。
2、ENCODE Project Writes Eulogy for Junk DNA
Elizabeth Pennisi
Sep 7, 2012; 337:1159-1161
近期zui受矚目的ENCODE項(xiàng)目，為垃圾”DNA正名。
科學(xué)家們*次對(duì)人類基因組進(jìn)行測(cè)序時(shí)驚奇地發(fā)現(xiàn)，在長(zhǎng)達(dá)30億堿基的人類基因組中，傳統(tǒng)意義上的基因（即編碼蛋白質(zhì)的段）居然如此。zui開始科學(xué)家們預(yù)測(cè)在人類基因組中至少應(yīng)該存在10萬或更多的基因，可是zui后他們才找到了大約3.5萬個(gè)基因，而且zui終得到確認(rèn)的基因只有2.1萬個(gè)左右。剩余的大量DNA全都是沒有用的“垃圾”，至少在當(dāng)時(shí)看起來是如此。
3、Systematic Localization of Common Disease-Associated Variation in Regulatory DNA
Matthew T. Maurano, Richard Humbert, Eric Rynes, Robert E. Thurman, Eric Haugen, Hao Wang, Alex P. Reynolds, Richard Sandstrom, Hongzhu Qu, Jennifer Brody, Anthony Shafer, Fidencio Neri, Kristen Lee, Tanya Kutyavin, Sandra Stehling-Sun, Audra K. Johnson, Theresa K. Canfield, Erika Giste, Morgan Diegel, Daniel Bates, R. Scott Hansen, Shane Neph, Peter J. Sabo, Shelly Heimfeld, Antony Raubitschek, Steven Ziegler, Chris Cotsapas, Nona Sotoodehnia, Ian Glass, Shamil R. Sunyaev, Rajinder Kaul, John A. Stamatoyannopoulos
Sep 7, 2012; 337:1190-1195
這篇文章與上一篇文章是一系列，文中來自中科院北京基因組研究所重大疾病基因組與個(gè)體化醫(yī)療實(shí)驗(yàn)室的渠鴻竹博士參與了這項(xiàng)研究，這項(xiàng)研究突破性地從表觀基因組水平進(jìn)行GWAS分析，并在系統(tǒng)生物學(xué)理論的指導(dǎo)下，通過統(tǒng)合的生物信息學(xué)分析策略，建立了疾病與生物學(xué)性狀之間關(guān)聯(lián)性的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型，為闡明人類常見疾病與基因性狀之間的相互關(guān)系提供了嶄新的科學(xué)視角和有力的研究工具。
4、Will an Aspirin a Day Keep Cancer Away?
Jocelyn Kaiser
Sep 21, 2012; 337:1471-1473
經(jīng)常服用阿司匹林可以降低癌癥風(fēng)險(xiǎn)，近年來隨著這些研究數(shù)據(jù)地不斷累積一些人認(rèn)為是到了建議更多人服用這種藥物的時(shí)候了。
統(tǒng)計(jì)長(zhǎng)年服用阿司匹林防止如心臟病和中風(fēng)等心血管事件的人群癌癥病例，這些研究發(fā)現(xiàn)幾種腫瘤類型的死亡率下降了37%。甚至在形成癌癥的人群中，服用阿司匹林似乎也減慢了腫瘤擴(kuò)散至身體其他部位。“這只是*個(gè)原理驗(yàn)證任何單一的化合物可以減少某些癌癥的風(fēng)險(xiǎn)，”英國(guó)牛津大學(xué)研究員Peter Rothwell說。
這些報(bào)告提出了誘人的可能性即阿司匹林可作為*種提供給一般群體的抗癌藥物。“它使關(guān)于阿司匹林用于癌癥預(yù)防的風(fēng)險(xiǎn)和利益辯論發(fā)生了改變，”麻省總醫(yī)院結(jié)直腸癌研究人員Andrew Chan說。
5、The Emerging Biology of Autism Spectrum Disorders
Matthew W. State, Nenad Sestan
Sep 14, 2012; 337:1301-1303
科學(xué)家們對(duì)自閉癥譜系病（autism spectrum disorders，即包括典型自閉癥和其他阿斯伯格綜合癥等不典型自閉癥在內(nèi)的一系列疾病）患兒正處于發(fā)育階段的大腦中都有哪些基因的表達(dá)出現(xiàn)了異常進(jìn)行了深入的研究，這些研究成果可以為我們了解自閉癥提供一個(gè)全新的思路。
多個(gè)研究都發(fā)現(xiàn)罕見的或者新發(fā)的點(diǎn)突變（point mutations）和染色體結(jié)構(gòu)上的亞顯微結(jié)構(gòu)變異（submicroscopic variations）都和ASD有關(guān)。同時(shí)也發(fā)現(xiàn)一些基因組間隔（genomic intervals）和基因也會(huì)增加ASD的患病風(fēng)險(xiǎn)。這些研究成果為我們深入認(rèn)識(shí)ASD的生物學(xué)本質(zhì)打下了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。zui開始對(duì)原發(fā)型自閉癥患者（非同源的）開展的遺傳學(xué)研究表明，突觸粘附分子（synaptic adhesion molecules）和突觸后密度蛋白（postsynaptic density proteins）也都與ASD有關(guān)。zui近新發(fā)現(xiàn)的一些ASD蛋白又進(jìn)一步擴(kuò)充了這個(gè)隊(duì)伍，其中就包括染色質(zhì)修飾物CHD8、DNA結(jié)合蛋白POGZ、離子通道蛋白SCN2A、微管相關(guān)蛋白KATNAL2、神經(jīng)遞質(zhì)受體GRIN2B和磷酸化調(diào)控的酪氨酸激酶DYRK1A等。
隨著相關(guān)科學(xué)研究的不斷深入，科學(xué)家們還在陸續(xù)發(fā)現(xiàn)新的與ASD患病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的基因，現(xiàn)在這類基因的數(shù)目已經(jīng)達(dá)到了好幾百個(gè)，但是其中還沒有哪一個(gè)基因具有“優(yōu)勢(shì)”，每一個(gè)基因在整個(gè)ASD患者人群中的影響力都不會(huì)超過1%。這種“多對(duì)一（many-to-one）”的現(xiàn)象表明我們?cè)诮窈蟮墓ぷ髦袘?yīng)該把眼光放寬一點(diǎn)，不要再局限于某一個(gè)突變的影響作用。zui近的研究帶來的另外一個(gè)震撼就是在不同的ASD疾病中觀察到了不同風(fēng)險(xiǎn)因素之間相互重疊的現(xiàn)象，這從概念上對(duì)自閉癥研究領(lǐng)域也是一大沖擊。在不同個(gè)體間發(fā)現(xiàn)的這些高滲透突變（penetrant variants）具有很大的影響力，但是它們導(dǎo)致的結(jié)果卻是多種多樣的，比如會(huì)導(dǎo)致ASD、癲癇（epilepsy）、智力障礙（inlectual disability）、精神分裂癥（schizophrenia）以及其它多種疾病。這種“一對(duì)多（one-to-many）”的現(xiàn)象以及基因的多效性（pleiotropy）機(jī)制使ASD的問題變得更加復(fù)雜，而ASD疾病對(duì)我們?nèi)祟愒斐傻?傷害（例如語言交流能力障礙等）又讓構(gòu)建動(dòng)物模型幾乎成為不可能。不過可以通過動(dòng)物實(shí)驗(yàn)或者體外細(xì)胞培養(yǎng)等技術(shù)研究某些基因突變對(duì)生物學(xué)通路的影響作用，zui關(guān)鍵的問題可能會(huì)是如何判斷哪些分子、細(xì)胞和神經(jīng)通路等不同層面上的表型與ASD相關(guān)。
6、Genomics’ Big Talker
Elizabeth Pennisi
Sep 7, 2012; 337:1167-1169
7、A Killer-Protector System Regulates Both Hybrid Sterility and Segregation Distortion in Rice
Jiangyi Yang, Xiaobo Zhao, Ke Cheng, Hongyi Du, Yidan Ouyang, Jiongjiong Chen, Shuqing Qiu, Jianyan Huang, Yunhe Jiang, Liwen Jiang, Jihua Ding, Jia Wang, Caiguo Xu, Xianghua Li, Qifa Zhang
Sep 14, 2012; 337:1336-1340
這篇文章由中國(guó)科學(xué)家完成，從1990年開始，張啟發(fā)課題組經(jīng)過18年不懈的努力，并與多家研究單位合作，于2008年成功克隆了S5位點(diǎn)的5號(hào)基因，該成果2008年在《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》發(fā)表。然而，仍然使他們困惑的是，僅5號(hào)基因的作用無法解釋該位點(diǎn)引起雜種不育的機(jī)理。又歷經(jīng)4年，此次發(fā)表的成果表明，兩個(gè)與之緊密連鎖的基因（3號(hào)和4號(hào)基因）與5號(hào)基因協(xié)同作用控制雜種不育及廣親和現(xiàn)象。在秈稻中，3號(hào)和5號(hào)基因有功能（3+，5+），4號(hào)基因沒有功能（4-）;粳稻則相反，4號(hào)基因有功能（4+），3號(hào)、5號(hào)沒有功能（3-，5-）。有功能的5號(hào)與4號(hào)基因一起（4+，5+），構(gòu)成殺手，而3號(hào)基因（3+）則行使保護(hù)者作用。在雌配子（又稱卵子）形成過程中，4號(hào)和5號(hào)基因（4+，5+）共同作用殺死配子，秈型配子由于3+的保護(hù)，正常存活，粳型配子（3-）無3+的保護(hù)而死亡。其結(jié)果，秈粳雜種表現(xiàn)為半不育。廣親和品種沒有殺配子的功能，故能與秈、粳稻均能產(chǎn)生正常可育雜種。
這項(xiàng)研究從分子水平對(duì)S5的作用機(jī)理進(jìn)行了比較完善的闡述，揭示了水稻秈粳雜種育性調(diào)控的分子機(jī)制，為有關(guān)秈粳雜種不育、物種生殖隔離分子機(jī)理、生物進(jìn)化的研究提供了借鑒和參考。該項(xiàng)成果在水稻品種改良中有廣闊的應(yīng)用前景，其有關(guān)信息可被直接用于發(fā)掘其他廣親和基因，培育廣親和品種，進(jìn)而有效地跨越生殖隔離，克服水稻秈粳亞種間雜種的不育性，利用秈粳亞種間強(qiáng)大的雜種優(yōu)勢(shì)提高水稻產(chǎn)量。
這篇文章同樣聚焦于ENCODE項(xiàng)目，不過是從一位參與的研究人員身上說起，Ewan Birney是一位自學(xué)成才的程序員，但是現(xiàn)在他卻是英國(guó)歐洲生物信息研究所（European Bioinformatics Institute in Hinxton, U.K）的一名生物信息學(xué)家。Birney充分發(fā)揮了他的口才，“拉攏了”442位科研人員一起來破解人類基因組密碼，他們不僅會(huì)破解基因的功能，同時(shí)也沒有放過其它的非編碼功能元件，簡(jiǎn)而言之就是“一個(gè)都不能少”。這項(xiàng)繼人類基因組計(jì)劃之后zui偉大的基因組研究項(xiàng)目就是DNA元件百科全書項(xiàng)目
（Encyclopedia of DNA Elements, ENCODE）。ENCODE項(xiàng)目組在本周就發(fā)表了30篇科研論文，他們已經(jīng)初步揭開了人類基因組DNA的面紗。Birney在這個(gè)項(xiàng)目里主要負(fù)責(zé)數(shù)據(jù)分析方面的工作，他還和他在歐洲生物信息研究所的助手Ian Dunham一起負(fù)責(zé)制定質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)，開發(fā)標(biāo)準(zhǔn)操作流程，發(fā)表科研結(jié)果以及開發(fā)解讀基因組數(shù)據(jù)的新方案等工作。美國(guó)馬里蘭州貝塞斯達(dá)美國(guó)國(guó)立健康研究院（U.S. National Institutes of Health in Bethesda, Maryland）的院長(zhǎng)Francis Collins就指出，如果沒有Birney的領(lǐng)導(dǎo)，ENCODE項(xiàng)目不可能開展得這么順利。
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